Dans un premier temps, connaitre les différentes stratégies pour la validation
par spectrométrie de masse (LC-MRM) d’un biomarqueur protéique/peptidique
identifié en amont par d’autres technologies.
- Présentation exhaustive des différentes approches envisageables : pré-analytique
et analytique
Dans un deuxième temps, le module inclut un exemple concret d’application LCMRM
afin d’illustrer l’approche utilisée pour valider un biomarqueur :
- Purification de la cible d’intérêt par des approches biochimiques
- Design d’une méthode ciblée de spectrométrie de masse
- Validation de méthode incluant les contrôles qualités
- Analyse LC-MRM
- Retraitement/analyses des données
Ateliers pratiques :
- Préparation d’échantillon pour une analyse protéomique
- Quantification par LC-MRM (Triple quadripôle)
- Analyse/interprétation des données par Skyline